EFファイルの統合は、EファイルとFファイルを縦方向に連結し、穴埋めをすることで可能です。色々な方法が考えられますが、Pandasでの実装が最も容易です。便利なメソッドにおんぶにだっこで、手っ取り早くEF統合をやってみましょう。

DPCデータのEFファイル統合スクリプトを作成しました。EファイルとFファイルの統合ツールとして、PRISMのEF統合ツールが公開されていますが、2017年度版は６月まで公開されません。 つなぎのためのスクリプトです。